ροή εργασίας ενός πειράματος ChIP-on-chip

ξεκινώντας με μια βιολογική ερώτηση, ένα πείραμα ChIP-on-chip μπορεί να χωριστεί σε τρία βασικά βήματα: Το πρώτο είναι να ρυθμίσετε και να σχεδιάσετε το πείραμα επιλέγοντας τον κατάλληλο τύπο πίνακα και ανιχνευτή. Δεύτερον, το πραγματικό πείραμα εκτελείται στο υγρό εργαστήριο. Τέλος, κατά τη διάρκεια του ξηρού εργαστηρίου του κύκλου, τα δεδομένα που συλλέγονται αναλύονται για να απαντήσουν είτε στην αρχική ερώτηση είτε να οδηγήσουν σε νέες ερωτήσεις έτσι ώστε ο κύκλος να μπορεί να ξεκινήσει ξανά.

υγρό τμήμα εργαστηρίου της ροής εργασίας

ςτο πρώτο βήμα, η πρωτεΐνη που ενδιαφέρει (POI) είναι διασυνδεδεμένη με την τοποθεσία DNA στην οποία συνδέεται σε περιβάλλον in vitro. Συνήθως αυτό γίνεται με μια ήπια στερέωση φορμαλδεΰδης που είναι αναστρέψιμη με θερμότητα.

ςτη συνέχεια, τα κύτταρα λύονται και το DNA 2Α2 διασπάται με υπερήχους ή χρησιμοποιώντας μικροκοκκική νουκλεάση. Αυτό οδηγεί σε κομμάτια διπλής έλικος DNA θραυσμάτων, φυσικά μήκους 1 kb ή λιγότερο. Αυτά που ήταν διασυνδεδεμένα με το POI σχηματίζουν POI-DNA complex .

Εικόνα 127Α | Επισκόπηση ροής εργασίας ενός πειράματος ChIP-on-chip. | Zirguezi / CC0 | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:ChIP-on-chip_workflow_overview.svg) από το Wikimedia Commons

Συγγραφέας : Milos Pawlowski

Παραπομπές:

Τεχνικές Μοριακής Βιολογίας Ι

Εργαλεία Μοριακής Βιολογίας II