δημιουργήθηκε βάση δεδομένων αναφοράς

ςτις 13 Ιουνίου 2012, ένα σημαντικό ορόσημο του HMP ​​ανακοινώθηκε από τον διευθυντή NIH Francis Collins. Η ανακοίνωση συνοδεύτηκε από μια σειρά συντονισμένων άρθρων που δημοσιεύθηκαν στο Nature και σε διάφορα περιοδικά, συμπεριλαμβανομένης της Δημόσιας Βιβλιοθήκης Επιστημών( PLoS) την ίδια ημέρα. Χαρτογραφώντας την κανονική μικροβιακή σύνθεση υγιών ανθρώπων χρησιμοποιώντας τεχνικές προσδιορισμού αλληλουχίας γονιδιώματος, οι ερευνητές του HMP ​​δημιούργησαν μια βάση δεδομένων αναφοράς και τα όρια της φυσιολογικής μικροβιακής διακύμανσης στους ανθρώπους.

από 242 υγιείς εθελοντές των ΗΠΑ, συλλέχθηκαν περισσότερα από 5.000 δείγματα από ιστούς από 15 (άνδρες) έως 18 (γυναίκες) περιοχές σώματος, για παράδειγμα στόμα, μύτη, δέρμα, κάτω έντερο (κόπρανα) και κόλπος. Όλα τα DNA, ανθρώπινα και μικροβιακά, αναλύθηκαν με DNA μηχανές προσδιορισμού αλληλουχίας. Τα δεδομένα του μικροβιακού γονιδιώματος εκχυλίστηκαν με ταυτοποίηση του βακτηριακού ειδικού ριβοσωμικού RNA, 16S rRNA. Οι ερευνητές υπολόγισαν ότι περισσότερα από 10, 000 μικροβιακά είδη καταλαμβάνουν το ανθρώπινο οικοσύστημα και έχουν εντοπίσει το 81 - 99% των γενών. Επιπλέον, για τη δημιουργία της βάσης δεδομένων αναφοράς για τα ανθρώπινα μικρόβια, το έργο HMP ανακάλυψε επίσης πολλές "εκπλήξεις", οι οποίες περιλαμβάνουν:

Εικόνα 330A | Γραφική απεικόνιση του μικροβιώματος του ανθρώπινου δέρματος, με σχετικούς επιπολασμούς διαφόρων κατηγοριών βακτηρίων | Darryl Leja, NHGRI / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Skin_Microbiome20169-300.jpg) από το Wikimedia Commons

Εικόνα 330A | Γραφική απεικόνιση του μικροβιώματος του ανθρώπινου δέρματος, με σχετικούς επιπολασμούς διαφόρων κατηγοριών βακτηρίων | Darryl Leja, NHGRI / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Skin_Microbiome20169-300.jpg) από το Wikimedia Commons

Συγγραφέας : Rogers Nilstrem

Παραπομπές:

Ιατρική Μικροβιολογία Ι: Παθογόνα και ανθρώπινα μικροβιοκτόνα

Κλινική μικροβιολογία

Σχόλια