αιτία και έλεγχος της γονιδιωματικής ποικιλομορφίας

τα δυναμικά γονιδιώματα με υψηλή πλαστικότητα είναι απαραίτητα για να επιτρέψουν στα παθογόνα, κυρίως βακτήρια, να επιβιώσουν σε μεταβαλλόμενα περιβάλλοντα. Με τη βοήθεια μεθόδων προσδιορισμού αλληλουχίας υψηλής απόδοσης και σε τεχνολογίες silico, είναι δυνατό να αποκαλυφθούν, να συγκριθούν και να καταγραφούν πολλά από αυτά τα δυναμικά γονιδιωματικά γεγονότα. Η γονιδιωματική ποικιλομορφία είναι σημαντική κατά την ανίχνευση και τη θεραπεία ενός παθογόνου, καθώς αυτά τα συμβάντα μπορούν να αλλάξουν την υπηρεσία και τη σύσταση του παθογόνου. Υπάρχει ανάγκη ανάλυσης περισσότερων από ένα συνδυασμό γονιδιώματος ενός είδους παθογόνου για την κατανόηση των παθογόνων μηχανισμών. Η συγκριτική γονιδιωματική είναι μια μεθοδολογία που επιτρέπει στους επιστήμονες να συγκρίνουν τα γονιδιώματα διαφορετικών ειδών και στελεχών. Υπάρχουν πολλά παραδείγματα επιτυχημένων συγκριτικών μελετών γονιδιωματικής, μεταξύ των οποίων ο έλεγχος των Listeria και Escherichia coli. Ορισμένες μελέτες προσπάθησαν να αντιμετωπίσουν τη διαφορά μεταξύ παθογόνων και μη παθογόνων μικροβίων. Αυτή η έρευνα αποδεικνύεται δύσκολη, παρόλο που, δεδομένου ότι ένα είδος βακτηριδίου μπορεί να έχει πολλά στελέχη, και το γονιδιωματικό περιεχόμενο καθενός από αυτά τα στελέχη ποικίλλει.

Εικόνα 383A | Ένα τσιπ microarray περιέχει συμπληρωματικό DNA (cDNA) σε πολλές αλληλουχίες ενδιαφέροντος. Το cDNA φθορίζει όταν υβριδοποιείται με ένα αντίστοιχο θραύσμα DNA στο δείγμα. | Εθνικό Ινστιτούτο Καρκίνου / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Microarray_Comparative_Genomic_Hybridisation.jpg) από το Wikimedia Commons

Εικόνα 383A | Ένα τσιπ microarray περιέχει συμπληρωματικό DNA (cDNA) σε πολλές αλληλουχίες ενδιαφέροντος. Το cDNA φθορίζει όταν υβριδοποιείται με ένα αντίστοιχο θραύσμα DNA στο δείγμα. | Εθνικό Ινστιτούτο Καρκίνου / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Microarray_Comparative_Genomic_Hybridisation.jpg) από το Wikimedia Commons

Συγγραφέας : Merim Kumars

Παραπομπές:

Ιατρική Μικροβιολογία II: Αποστείρωση, Εργαστηριακή Διάγνωση και Ανοσοαπόκριση

Μοριακά διαγνωστικά στη μικροβιολογία

Σχόλια